bluecross,
代工厂工程人员管理角色其实与MPE还是有些差异的，我想你问的应该是MPE，而不是单纯的代工厂工程人员，MPE的角色基本上比较类似工厂内PE的角色，只是MPE比较类似半管理职，MPE基本上要负责产品，所以你或许也可以先将之想像成产品工程师，其最主要的职责是将新产品转移到代工厂之所有工程相关业务，从新产品设计一开始就要开始参预，直到产品量产后也都要负责。一般要提供制造工厂生产的相关知识与建议给RD，不要让RD设计出来的东西难以生产。
之所以说MPE 是半管理植是因为MPE不需要亲自安排工厂生产的相关制程与流程，这些东西代工厂内的PE与TE都会处理好，MPE只要确认工厂排出来的东西没有问题就可以了。唯一比较麻烦的是有心制程出现时，需要先去了解，或是与工厂一起研究。
MPE的职涯规划可以是MPE主管、NPI主管，甚至到公司内整个供应链主管VP (Supplier chain)。
另外，如果你是机构专业，有些MPE其实会兼CE的工作，也就是量产后的所有工程修改与维护，只要你的能力够强，其实你也有机会再可以朝研发的发向发展。
就你的例子，其实你已经有机构研发的背景，所以站在MPE角色会回过头来看RD的ME，你会比较清楚RD的想法，也会比较清楚该如何给RD建议，让他们设计出来的东西可以更符合制造的需求，经常见到很多RD天兵，只会设计，但无法生产。
至于研发与MPE的角色是有些差异的，RD的工作基本上比较单纯，就是接案子、画CAD、试模，要在要求的时间内把产品设计出来，MPE会比较杂一点，要代表工厂与RD沟通，还要协调整合工厂的资源，不过，工作上似乎比较也没有RD那么急迫。